Apoiar o desenvolvimento inter-regional do Sul através de programas de intervenção no território e de iniciativas inovadoras junto das comunidades, numa lógica interdisciplinar e em colaboração com o tecido económico e social da região, é uma das prioridades do Campus Sul.

Nesse sentido, foram criados os Centros de Conhecimento Aplicado e Inovação para a Sustentabilidade [CAIS] focados no desenho de soluções inovadoras em áreas específicas do desenvolvimento sustentável do Sul, a partir de infraestruturas já existentes.

As universidades do Algarve, Évora e NOVA de Lisboa são parceiras em vários projetos de investigação nacionais e europeus em diferentes domínios científicos, com especial enfoque nas áreas da Ciências Agrárias, Ciências Sociais, Ambiente e Património, permitindo conciliar os recursos e competências residentes em cada uma das universidades para criar novo conhecimento que apoiará a valorização da região sul de Portugal.

As universidades do Algarve, Évora e NOVA de Lisboa já oferecem ciclos de estudo em conjunto em várias áreas do conhecimento, ao nível dos mestrados e doutoramentos, proporcionando uma experiência de aprendizagem única, e mobilizando um vasto corpo académico.