As universidades do Algarve, Évora e NOVA de Lisboa são parceiras em vários projetos de investigação nacionais e europeus em diferentes domínios científicos, com especial enfoque nas áreas da Ciências Agrárias, Ciências Sociais, Ambiente e Património, permitindo conciliar os recursos e competências residentes em cada uma das universidades para criar novo conhecimento que apoiará a valorização da região sul de Portugal.